Ksiądz Jan Bogacki urodził się 10 kwietnia 1949 r. w Ulanowicach (powiat Grodków) w rodzinie robotniczej Pawła i Anny. Był najstarszy z trojga rodzeństwa. W 1951 r. cała rodzina przeprowadziła się do Krapkowic, co było związane z miejscem zatrudnienia ojca. W 1956 r. przyszły kapłan rozpoczął naukę w szkole podstawowej w Krapkowicach, a od 1963 r. kontynuował edukację w liceum ogólnokształcącym w Gogolinie. W 1967 r., bezpośrednio po egzaminie dojrzałości, wstąpił do Wyższego Seminarium Duchownego Śląska Opolskiego w Nysie.